被除名股东不配合变更，公司可依法申请。依据《公司法》等，公司应提交必要材料至工商局，20个工作日内应办结。拖延可能导致公司运营受阻、法律责任风险增加。
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处理此问题常见方式为协商、诉讼或行政投诉。首先尝试与股东协商，不成则考虑起诉或向工商局投诉，根据具体情况选择最佳途径。
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被除名股东不配合，处理方式如下：1.协商：与股东沟通，寻求和解。2.诉讼：若协商无果，向法院起诉，凭判决申请变更。3.投诉：向工商局投诉，请求协助变更。根据股东反应和公司情况灵活选择。