辞职被扣培训费不合理，除非有专门培训且企业支付费用。《劳动法》规定，不得无故克扣工资，否则属违法行为。若不及时处理，可能影响员工权益，甚至引发劳动纠纷。
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辞职被扣培训费，应这样处理：1.与单位沟通，要求说明扣费依据，协商解决；2.若协商无果，收集证据，如培训合同、工资单等，向劳动监察部门投诉；3.若投诉未解决，准备相关材料，申请劳动仲裁，维护自身权益。
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处理此问题可协商、投诉或仲裁。建议先与单位沟通协商，无果后向劳动监察部门投诉，仍无法解决则申请劳动仲裁，根据具体情况选择最佳方式。