在解除同居关系后，若双方对孩子的抚养权无法达成一致，法院将根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第四十六条的规定进行判决。法院会综合考虑双方的具体情况，包括生育能力、子女生活环境、是否患有严重疾病等因素，按照最有利于未成年子女的原则来做出判决。这意味着，法院将综合考虑多种因素，以确保孩子的最佳利益得到保障。
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若双方都想抚养孩子，法院在做决定时会考虑以下因素：
1. 一方是否已做绝育手术或丧失生育能力。
2. 子女随哪一方生活时间较长，改变环境是否不利。
3. 双方是否有其他子女。
4. 一方是否患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或其他不利于子女身心健康的情形。
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从法律角度，确保孩子权益在解除同居关系时得到保护的方法包括：
1. 双方应首先通过协商，尽量达成一致意见，确保孩子的抚养权和探视权得到合理安排。
2. 若协商不成，可寻求法律援助，通过法律途径解决抚养权争议。
3. 法院在审理过程中，会遵循最有利于未成年子女的原则，确保孩子的合法权益得到维护。